Test coronavirus : sérologique, PCR, où le faire, avec une ordonnance ?

[Mise à jour le lundi 18 mai 2020 à 21h25] Depuis le déconfinement, lundi 11 mai 2020, les Français qui présentent des symptômes évocateurs du Covid-19 peuvent bénéficier d'un dépistage par test PCR (dans le nez). Une nouveauté puisque jusqu'à cette date, seuls les plus à risque de formes graves du coronavirus et les soignants pouvaient être dépistés. Comment faire un test ? Où trouver un centre de dépistage près de chez soi ? A quel prix ? Faut-il toujours une ordonnance ?

Dépistage du coronavirus en France

La stratégie de dépistage du coronavirus en France a évolué. "Les premiers tests ont été distribués fin janvier-début février aux hôpitaux" rappelait le Pr Arnaud Fontanet, membre du Comité scientifique Covid-19 le 20 avril 2020. Au tout début, il avait été décidé de tester les personnes qui présentaient des symptômes d'atteintes respiratoires (toux, fièvre, essoufflement, syndrome de détresse respiratoire aigue) et s'il y avait eu un contact avec la Chine ou avec une personne revenant de Chine. Mais face à l'augmentation des cas et en pleine épidémie de grippe, tester toutes les personnes présentant de tels symptômes devenait impossible. D'autant que la France manquait de tests notamment parce que leur fabrication nécessite des produits importés de Chine et des États-Unis, qui n'étaient plus livrés en quantité suffisante. A partir du 14 mars quand la France est passée au stade 3 de l'épidémie, seules les personnes à risque étaient testées (soignants...). Le dépistage a été priorisé et étendu aux résidents des Ehpad et aux personnels qui les accompagnent le 6 avril. A partir du 11 mai, tous les Français qui présentent des symptômes évocateurs du Covid-19 peuvent être testés. L'Académie nationale de médecine préconise que seuls les tests recommandés le Centre national de Référence (CNR) qui a sélectionné les tests sur leurs performances analytiques (sensibilité et spécificité supérieures à 95%) et adaptés aux automates utilisés dans les laboratoires d'analyses médicales soient utilisés et remboursés s'ils sont prescrits. Dans son communiqué du 18 mai, l'Académie recommande que les tests sérologiques soient systématiquement associés aux tests PCR pour l'identification de foyers d'infections et la détection des contacts.

Pourquoi ne pas tester tout le monde le 11 mai ? "Ce n'est pas envisageable et surtout ça n'a pas d'utilité. Il faudrait retester tout le monde 8 jours plus tard et retester encore 15 jours plus tard", a répondu le Pr Delfraissy le 30 avril, qui reconnaît que "la mise à disposition des 700 000 tests par semaine est un pré-requis (au déconfinement). Si on n'a pas tout ça, ça ne va pas le faire le 11 mai."

En cas de difficulté à entrer en contact avec un médecin, contacter des médecins de garde au 0 800 130 000.

Types de tests de détection du coronavirus

Dans le contexte actuel d'urgence publique sanitaire, les laboratoires et les instituts de recherches développent des solutions de diagnostique permettant de détecter le virus SARS-Cov-2, responsable de l'épidémie Covid-19. Parmi les solutions proposées :

Test virologique ou PCR : dans le nez

C'est le test de dépistage utilisé en France depuis le début de l'épidémie. Le test diagnostique dit "virologique" ou "PCR" ("polymerase chain reaction") consiste en un prélèvement naso-pharyngé (gorge, nez, nasopharynx) qui se fait à l'aide d'un petit écouvillon (goupillon) inséré dans le nez. Il s'agit d'un test facile à effectuer, non invasif mais désagréable pour le patient car un peu douloureux. Il est obligatoirement effectué par un médecin ou une infirmière. Le résultat est disponible après 3 à 4 heures .L'échantillon est ensuite analysé par un laboratoire spécialisé afin de rechercher la présence du matériel génétique du coronavirus et ainsi confirmer le diagnostic de l'infection. Une étude chinoise publiée le 19 avril sur le site Clinical Infectious Diseases et rapporté par l'Inserm portant sur 56 patients Covid-19 hospitalisés présentant des symptômes légers à moyens montre que "l'excrétion de virus peut durer jusqu'à 6 semaines après l'apparition des symptômes. Les tests PCR se sont révélés positifs chez la majorité des patients durant les 3 premières semaines, et à partir de la quatrième, le nombre de tests négatifs a augmenté progressivement. Enfin, la durée médiane entre le début des symptômes et la fin de l'excrétion virale a été évaluée à 24 jours. Néanmoins, on ne sait pas si les malades peuvent transmettre le virus durant toute la période d'excrétion virale. L'étude suggère qu'une période d'observation prolongée soit nécessaire pour les patients plus âgés." 

Test sérologique

Les tests sérologiques automatisés de type ELISA (enzyme linked immunosorbent assay) et les tests sérologiques unitaires recherchent des anticorps liés au coronavirus dans le sang qui déterminer si une personne a déjà été infectée par le coronavirus. La plupart de ces tests sont encore en cours d'évaluation. Un seul test sérologique conçu par le groupe pharmaceutique suisse Roche a reçu le feu vert des autorités sanitaires britanniques le 14 mai. Le gouvernement britannique a indiqué vouloir s'en procurer "en quantité importante" le plus tôt possible."Il y a eu pas mal de désillusion avec les premiers tests proposés. Nos collèges espagnols et anglais en ont fait les frais. Ces tests vont s'améliorer, confiait le Pr Fontanet, le 30 avril. J'ai assez bon espoir que courant mai, on ait des tests qui deviennent fiables" indiquait-il. La réalisation d'un diagnostic sérologique permet la détection de la réponse immunitaire post-infectieuse humorale (détection des anticorps IgM, IgG et éventuellement IgA).

"On ne sait pas si les anticorps que vous avez sont protecteurs."

Que disent-ils ? "Ils disent : vous avez été en contact avec le virus mais aujourd'hui on n'est pas en mesure de dire si ce contact avec le virus s'accompagne d'une protection donc si vous pouvez vous considérer protégé d'une réinfection. On ne sait pas si les anticorps que vous avez sont protecteurs. L'autre problème c'est qu'avec les tests disponibles, ils ont encore un taux important de faux-positifs de l'ordre de 5% alors qu'on sait que la proportion de Français infectés sur le territoire est aussi de l'ordre de 5% donc on ne peut pas s'y fier aujourd'hui." 

C'est quoi la sérologie ? La sérologie est une méthode biologique utilisant le sérum pour établir des diagnostics médicaux. Le sérum est un constituant du plasma sanguin. Lors d'une prise de sang, le biologiste va analyser le sérum. La sérologie permet de poser un diagnostic des maladies infectieuses, des maladies auto-immunes, de déterminer les groupes sanguins, de suivre l'évolution de certaines maladies, de vérifier les vaccinations. 

Test rapide

De nouveaux tests moléculaires rapides et ultra-rapides (respectivement 45 et 15 minutes) sont en cours d'évaluation par le Centre national de référence des virus des infections respiratoires. On parle de "tests rapides d'orientation diagnostique" ou "TRODs". Ils sont présentés sous un format unitaire, détectant les anticorps à partir d'une simple goutte de sang en quelques minutes. Leurs performances analytiques (sensibilité et spécificité) ne sont pas encore connues. 

Test salivaire

EasyCov, le test salivaire de dépistage rapide (en 30 minutes) du Covid-19, à lecture simplifié, développé par le laboratoire Sys2Diag (CNRS-Alcediag et SkillCell) indique avoir obtenu "de très bonnes performances" en phase préliminaire de ses études cliniques sur le terrain. Les tests pratiqués sur 180 personnes : patients testés positifs au virus et sur le personnel soignant hospitalier supposé négatif au CHU de Montpellier ont démontré qu'ils sont "réalisable simplement, sans laboratoire. Il suffit de prélever de la salive - l'un des principaux vecteurs du virus - et de la placer avec les réactifs à 65°C pendant 30 minutes. Le personnel soignant peut alors lire le résultat à l'œil nu" indique le laboratoire le 27 avril. "Parallèlement, la chaîne de développement, de production et de distribution s'organise pour un déploiement rapide et massif du test aux personnels de santé dès le mois de mai" précise le laboratoire. Ce nouveau test a déjà été testé et validé avec de l'ARN viral isolé au laboratoire Sys2Diag, et avec du virus actif au Centre d'études des maladies infectieuses et pharmacologie anti-infectieuse (CNRS/Université de Montpellier). Les chercheurs ont désormais pour objectif le développement d'une version grand public d'Easycov.

A quoi sert le dépistage ?

Détecter le coronavirus permet de suivre l'évolution de l'épidémie dans le pays et la circulation du virus particulièrement depuis le déconfinement. Selon l'Inserm : "Le déconfinement ne sera pas efficace sans dépistage et mise à l'isolement systématique des personnes porteuses du Covid-19." Plusieurs types de coronavirus sont susceptibles d'entraîner des infections respiratoires dont les manifestations vont du simple rhume à la détresse respiratoire. "Dans les cas les plus sévères, un prélèvement biologique va permettre d'identifier le pathogène responsable. En complément, la réalisation d'un scanner ou d'une radiographie des poumons permet d'évaluer l'étendue des lésions pulmonaires et de déterminer la prise en charge de la personne", précise la spécialiste. A ces mesures, l'Académie de médecine ajoute le 18 mai ses recommandations dans le cadre de la stratégie nationale d'enquête autour des cas de Covid-19. Elle préconise que les personnes testées positives en PCR quel que soit le résultat de la sérologie, soient placées en isolement, suivies et testées chaque semaine jusqu'à la négativité du test PCR. Dans un second cas de figure : que les personnes ayant une sérologie et un test PCR négatifs soient placées en isolement pendant deux semaines et que la sortie de l'isolement soit conditionnée par un contrôle de la négativité du test PCR. Et en troisième cas de figure : que les personnes ayant un test PCR négatif et une sérologie positive, au moins une semaine après avoir présenté des signes cliniques compatibles avec une infection par le SARS-CoV-2, soient considérées comme immunisées et ne soient pas placées en isolement.

En attendant le résultat, le médecin vous demandera de rester chez vous pour ne prendre aucun risque pour vous et votre entourage.

Qui peut faire ce test ?

Depuis le 11 mai : "Si vous présentez des symptômes évocateurs, fièvre, toux, gène respiratoire, perte du goût ou de l'odorat, il faut agir, n'attendez pas que cela passe, a déclaré le ministre de la Santé Olivier Véran le 7 mai. Contactez votre médecin ou un médecin de garde ou le 15. Le médecin vous prescrira un test de dépistage s'il l'estime nécessaire. En attendant le résultat, le médecin vous demandera de rester chez vous pour ne prendre aucun risque pour vous et votre entourage. Si le test est positif, le médecin vous suivra et alertera l'Assurance maladie pour réaliser une enquête afin d'appeler les cas contacts."

Deuxième cas figure : vous êtes identifié comme "cas contact" d'une personne contaminée (qu'elle présente ou non des symptômes). Vous serez contacté par les services de l'Assurance Maladie qui vous demanderont de rester en "quatorzaine préventive" et vous indiqueront quand réaliser votre test (dans un délai de 24 heures, si vous vivez dans le même foyer que la personne contaminée, ou en observant un délai de 7 jours après votre dernier contact avec cette personne, si vous ne vivez pas avec elle). Vous devrez alors prendre rendez-vous dans un lieu d'examen médical. Aucune prescription médicale ne vous sera demandée.

Comment et où se faire dépister ?

Le dépistage du coronavirus se fait après consultation d'un médecin quand on présente des symptômes évocateurs. 

Il ne faut en aucun cas se rendre directement dans les laboratoires de biologie, mais les appeler au préalable.

• Pour les patients diagnostiqués à l'hôpital ou hospitalisés avec signes de gravité, ces tests sont réalisés dans les hôpitaux.  
• Pour les patients ayant des symptômes du Covid-19 et une ordonnance médicale, il est possible d'être testé dans les laboratoires en ville. Il est aussi possible de se faire tester à domicile par des équipes médicales qui se déplaceront si le médecin le juge nécessaire. Des drive de dépistage sont aussi mis en place par les laboratoires. 
• Sans ordonnance, aux personnes identifiées comme ayant été en contact, avec un risque élevé de transmission, avec une personne testée positivement. Vous serez alors contacté par les services de l'Assurance Maladie qui vous demanderont de rester en "quatorzaine préventive" et vous indiqueront quand réaliser votre test (immédiatement si vous vivez dans le même foyer que la personne contaminée, ou en observant un délai de 7 jours après votre dernier contact avec cette personne, si vous ne vivez pas avec elle). Vous devrez alors prendre rendez-vous dans un lieu d'examen médical. Aucune prescription médicale ne vous sera demandée.
• A certains publics dans le cadre de campagnes spécifiques de dépistage : les personnes vulnérables, résidents de structures d'hébergement collectif et personnels exerçant dans ces structures en cas de premier cas confirmé au sein de la structure.

Une fois que le lieu de dépistage est identifié (le plus proche du domicile du patient), il faut les contacter pour prendre rendez-vous. Si le laboratoire réalise le test sur place, il faut venir avec sa carte d'identité, Carte Vitale et l'ordonnance. Sans oublier de porter un  masque. De retour à la maison, il faut rester confiné en attendant les résultats qui seront communiqués dans les 24 heures. 

→ Trouver un centre de dépistage sur Sante.fr

Faut-il avoir une ordonnance ?

Les tests PCR peuvent être réalisés avec ou sans ordonnance selon deux cas de figure :

• vous présentez des symptômes : il vous faut une ordonnance médicale pour bénéficier d'un test de dépistage du coronavirus.
• vous êtes identifié comme ayant été en contact, avec un risque élevé de transmission, avec une personne testée positivement : dans ce cas, vous n'avez pas besoin d'ordonnance pour être dépisté. 

Délai de résultats 

Le délai pour avoir un résultat de test PCR est entre trois et cinq heures au laboratoire. Le résultat de cet examen est rendu au patient dans les 24 heures, et au médecin prescripteur, avec information à la cellule d'intervention de Santé Publique France en région, à l'Agence régionale de santé et au centre de crise de la Direction Générale de la Santé. 

Test positif : que faire après ?

Depuis le 11 mai, "dès lors que la personne aura été testée positive, tous les cas contacts seront testés et invités à s'isoler" avait indiqué Olivier Véran le 7 mai.  L'objectif étant d'isoler au plus vite les porteurs pour casser la chaîne de transmission du virus. "Si le test est positif, le médecin vous suivra et alertera l'Assurance maladie pour réaliser une enquête et appeler les cas contacts" a poursuivi le ministre de la Santé. Un isolement à domicile sera mis en place pour une durée de 8 à 10 jours. Si les symptômes s'aggravent, n'attendez pas, appelez le médecin ou le 15.

Isolement à domicile

En cas de test positif au coronavirus, vous devez vous isoler. "Si vous partagez votre logement, restez dans une pièce spécifique en évitant les contacts avec les autres personnes du domicile, a détaillé le ministre de la Santé, il ne faut pas toucher les objets touchés par les autres personnes, aérer votre domicile, porter en permanence un masque, les visites sont déconseillées, vous pourrez aller chercher des masques en pharmacie sans ordonnance." Le médecin pourra vous proposer d'effectuer un isolement hors du domicile si besoin, par exemple dans des hôtels prévus pour ce cas de figure. 

Etes-vous cas possible, probable ou confirmé ?

En fonction des symptômes présentés, un patient peut être suspecté d'avoir le virus Sars-Cov-2, possiblement infecté ou confirmé. 

• Cas possible : Toute personne présentant des signes cliniques d'infection respiratoire aiguë avec une fièvre ou une sensation de fièvre, ET Ayant voyagé ou séjourné dans une zone d'exposition à risque dans les 14 jours précédant la date de début des signes cliniques.

OU Toute personne, même sans notion de voyage/séjour dans une zone d'exposition à risque ou de contact étroit avec un cas confirmé de COVID-19, présentant une pneumonie pour laquelle une autre étiologie a été préalablement exclue sur la base de critères cliniques, radiologiques et/ou virologiques et dont l'état clinique nécessite une hospitalisation OU des signes de détresse respiratoire aiguë pouvant aller jusqu'au SDRA (Syndrome de détresse respiratoire aiguë) dans un contexte possiblement viral et sans autre étiologie évidente d'emblée.

• Cas probable : Toute personne présentant des signes cliniques d'infection respiratoire aiguë dans les 14 jours suivant un contact étroit avec un cas confirmé de COVID-19. 
• Cas confirmé : patients, symptomatique ou non, avec un prélèvement biologique confirmant la présence du SARS-CoV-2..
• Cas contact : personne ayant été en contact avec un "cas confirmé" avec différents niveaux de risque : négligeable, faible et modéré/élevé. Un contact étroit est une personne qui, à partir de 24h précédant l'apparition des symptômes d'un cas confirmé, a partagé le même lieu de vie (famille, même chambre) ou a eu un contact direct avec lui, en face à face, à moins d'1 mètre du cas et/ou pendant plus de 15 minutes, lors d'une discussion ; flirt ; amis intimes ; voisins de classe ou de bureau ; voisins du cas dans un moyen de transport de manière prolongée ; personne prodiguant des soins à un cas confirmé ou personnel de laboratoire manipulant des prélèvements biologiques d'un cas confirmé, en l'absence de moyens de protection adéquats.

→ Si vous êtes cas contact "le plus souvent vous serez contacté par l'Assurance maladie ou l'ARS. Vous devrez éviter les contacts avec votre entourage, prendre votre température deux fois par jour, a indiqué Olivier Véran. Si vous pouvez téletravailler, très bien, sinon un arrêt de travail vous sera adressé. Sept jours après le dernier contact avec la personne malade vous serez testé par PCR. Si le test revient  négatif, le médecin pourra alléger votre isolement mais il devra persister 7 jours supplémentaires."

Test négatif

Même si le résultat du test est négatif, le patient ne doit avoir aucun contact avec des personnes fragiles pendant une semaine personnes âgées de 65 ans et plus, porteuses d'une maladie chronique, avec obésité importante ou femme enceintes au 3e trimestre de grossesse. Il sort du domicile en portant systématiquement un masque. Il ne reprend pas le travail sauf en télétravail et ne prend pas les transports en commun. L'Assurance Maladie pourra le cas échéant lui adresser un arrêt de travail pour couvrir la période où il doit rester isoler.

Quel est le prix des tests et la prise en charge ?

Le coût du test de dépistage du coronavirus par PCR est de 54 euros. Il est pris en charge à 100% par l'Assurance Maladie. La grande majorité des laboratoires dispensent de l'avance de frais. En cas de doute, contactez le centre de dépistage, ou prévoyez une avance.

Sources :

Avis du Conseil scientifique COVID-19 2 avril 2020 Etat des lieux du confinement et critères de sortie.

Publication de l'Institut Pasteur, résultats de tests sérologiques, 23 avril 2020.

Information du Gouvernement, Tests et dépistage, 10 mai 2020.

Merci à Marie-Françoise Gros, Directrice des Affaires Médicales chez bioMérieux, spécialiste français du diagnostic médical.